琉球學術界、文化界為了重現《歷代寶案》之完璧並精益求精，乃廣肆搜求琉球歷史檔案文獻，重新校訂、註釋《歷代寶案》。在這項重大的校勘工程上，分藏國立故宮博物院及北京中國第一歷史檔案館的中琉檔案史料極其重要不可或缺，琉球方面藉由赤嶺守教授代表「沖繩美島財團」向本院提出合作出版之邀請與贊助，促成《清代琉球史料彙編》編印美事。本院規劃以三年時間編輯出版《清代琉球史料彙編》，包括：《宮中檔硃批奏摺》、《軍機處檔奏摺錄副》以及其他《檔冊》中之琉球史料輯錄，以完整呈現本院豐富的院藏清代中琉檔案。